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	Provedor de dados Rev. Bras. Frutic. (4) Scientia Agricola (3) Rev. Bras. Ciênc. Solo (3) Agricultura Técnica (2) BJID (1) BJMBR (1) Electron. J. Biotechnol. (1) Genet. Mol. Biol. (1) PAB (1) Rev. Bras. Ciênc. Avic. (1) Mais... Autor Bianchi,Valmor João (4) Fachinello,José Carlos (4) Miguel,Pablo (3) Barros,Everaldo Gonçalves de (2) Dalmolin,Ricardo Simão Diniz (2) Hinrichsen,Patricio (2) Moura-Bueno,Jean Michel (2) Pedron,Fabrício de Araújo (2) Schuch,Márcia Wulff (2) Tiecher,Tales (2) Aguirre,Carlos (1) Alvarado,Roberto (1) Alvarez,Jimmy Walter Rasche (1) Arantes,Flávio Cese (1) Bertini,Cândida H.C. de Magalhães (1) Capoane,Viviane (1) Cardoso,Guilherme (1) Carvalho,Alexandre Zanardo de (1) Ciotti,Lucas Henrique (1) Costa,Sérgio Olavo Pinto da (1) Mais... Palavra-chave Fingerprinting (18) Molecular markers (4) Marcadores moleculares (3) SSR (3) Elementos traçadores (2) Erosão hídrica (2) ADN (1) AFLP (1) AIDS (1) Banco de germoplasma (1) Body weight (1) Butia capitata Mart. (1) Calidad panadera (1) Certificação genética (1) Cultivar identification (1) Cultivar protection (1) Cultivares chilenos de arroz (1) Diversidad genética (1) Elementos traçadores naturais (1) Genealogy (1) Mais... Tipo do documento Info:eu-repo/semantics/article (15) Journal article (3) Ano 2017 (1) 2014 (3) 2011 (1) 2009 (1) 2008 (3) 2006 (2) 2005 (1) 2004 (2) 2003 (2) 2000 (1) 1998 (1) Mais... País Brazil (15) Chile (3) Idioma Inglês (8) Português (8) Espanhol (2)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 18 Primeira ... 1 ... Última Caracterização molecular de butiazeiro por marcadores RAPD Rev. Bras. Frutic. Nunes,Adrise Medeiros; Bianchi,Valmor João; Fachinello,José Carlos; Carvalho,Alexandre Zanardo de; Cardoso,Guilherme. O grupo botânico Arecaceae é de extremo interesse por compreender plantas em extinção e por apresentar um grande potencial de exploração econômica. O butiazeiro (Butia capitata (Mart.) Becc.) ocorre naturalmente no Sul do Brasil. Sua caracterização molecular é de extremo interesse para futuros trabalhos de melhoramento genético. Assim sendo, verificou-se a variabilidade genética existente entre vinte e dois genótipos de butiazeiro da espécie (Butia capitata), pertencentes ao BAG (Banco Ativo de Germoplasma) de frutíferas nativas do Centro Agropecuário da Palma - UFPel. Esses genótipos foram analisados usando marcadores do tipo RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Um total de 136 fragmentos foram obtidos, sendo 77 polimórficos. O primer OPA11 apresentou... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Butia capitata Mart.; Marcadores moleculares; Variabilidade genética; Fingerprinting. Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452008000300024 Caracterização molecular de cultivares de pessegueiro e nectarineira com microssatélites Rev. Bras. Frutic. Bianchi,Valmor João; Fachinello,José Carlos; Schuch,Márcia Wulff; Sansavini,Silveiro. Na certificação de mudas de plantas frutíferas, a identificação genética é importante em todas as etapas do processo de produção. Em pessegueiro, a identificação de genótipos baseada somente em características morfofenológicas deixa dúvidas quanto à verdadeira identidade de algumas cultivares. Marcadores moleculares de microssatélies foram utilizados objetivando a caracterização molecular de 8 cultivares de nectarineira e 28 de pessegueiro. Para a análise, foram utilizados 13 incializadores de microssatélites (primers), sendo que todos foram marcadores produzindo polimorfismo suficiente para identificar 32 das 36 cultivares analisadas. A maior similaridade genética verificada nas cultivares para consumo in natura foi entre Coral e Planalto (0,94) e entre... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Pruus persica; Simples seqüências repetidas; Fingerprinting. Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452004000300028 Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélites Rev. Bras. Frutic. Martins,Antonio Baldo Geraldo; Rodrigues,Maria Gabriela Fontanetti; Paula,Deise Reis de; Mendes,Hélio Sandoval Junqueira; Arantes,Flávio Cese; Silva,Cristina Lacerda Soares Petrarolha. Pertencente à família Lauraceae, o abacateiro compreende três raças hortícolas: antilhana, guatemalense e mexicana. Os marcadores moleculares são uma ferramenta rápida e eficaz para estudos genômicos, uma vez que detectam o polimorfismo diretamente ao nível do DNA e não sofrem qualquer tipo de influência ambiental. Com base nesse polimorfismo, é possível fazer inferências sobre as relações entre o genótipo e o fenótipo dos indivíduos, o que, em última análise, permite aumentar a eficiência dos programas de melhoramento. Diante o exposto, o objetivo foi investigar a diversidade genética entre sete variedades de abacate a partir de 5 lócus de marcadores moleculares microssatélites (SSR). Nas amostras de abacateiros avaliadas, encontrou-se um total de 18... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Persea americana; SSR; Fingerprinting; Banco de germoplasma. Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452011000400016 Characterization and genetic diversity analysis of cotton cultivars using microsatellites Genet. Mol. Biol. Bertini,Cândida H.C. de Magalhães; Schuster,Ivan; Sediyama,Tocio; Barros,Everaldo Gonçalves de; Moreira,Maurílio Alves. Genetic diversity and the relationship between varieties are of great importance for cotton breeding. Our work was designed to estimate the informativeness of the cotton (Gossypium hirsutum L.) simple sequence repeat (SSR) microsatellite locus and to estimate the genetic distance between 53 cotton cultivars as well as to select a set of SSR primers able to differentiate between the 53 cotton cultivars studied. After extracting DNA from the 53 cultivars and characterized it using 31 pairs of SSR primers we obtained a total of 66 alleles with an average of 2.13 alleles per SSR locus and values of polymorphism information content (PIC) varying from 0.18 to 0.62, the dissimilarity coefficient varying from zero to 0.41. Statistical analysis using the unweighted... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fingerprinting; Gossypium hirsutum L.; Genealogy; Molecular markers. Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572006000200021 Characterization of selection effects on broiler lines using DNA fingerprinting Rev. Bras. Ciênc. Avic. Schmidt,GS; Hellmeister Filho,P; Zanella,EL. The objective of this study was to evaluate the effect of selection for body weight on the genetic variability and diversity in broiler lines. Two paternal broiler lines (LL and LLc) were used. LL line was selected for 12 generations for growth and carcass and reproduction characteristics. The LLc line was established from LL line in 1985 and mated at random. Blood samples from six chickens per line were collected and used for molecular analysis. Also, a DNA pool was made for each line to compare effects between lines. Data were analyzed considering the collected information on the presence or absence of DNA bands. Band sharing scores were calculated using the DICE coefficient. The pattern of the 21 most representative bands was used. DNA fingerprinting... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Body weight; Fingerprinting; Molecular markers; Variability. Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-635X2003000200005 Comparison of PCR-based molecular markers for the characterization of Proteus mirabilis clinical isolates BJID Michelim,Lessandra; Muller,Gabriela; Zacaria,Jucimar; Delamare,Ana Paula Longaray; Costa,Sérgio Olavo Pinto da; Echeverrigaray,Sergio. Proteus mirabilis is one of the most important pathogens associated with complicated urinary tract infections (acute pyelonephritis, bladder infections, kidney stones) and bacteremia, affecting patients with anatomical abnormalities, immunodeficiency, and long-term urinary catheterization. For epidemiological purposes, various molecular typing methods, such as pulse-field gel electrophoresis (PFGE) or ribotyping, have been developed for this pathogen. However, these methods are labor intensive and time-consuming. We evaluated the discriminatory power of several PCR-based fingerprinting methods (RAPD, ISSR, ERIC-PCR, BOX-PCR and rep-PCR) for P. mirabilis clinical isolates. Typing patterns and clustering analysis indicated that RAPD, BOX-PCR and ERIC-PCR... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Proteus mirabilis; Molecular markers; Fingerprinting; PCR. Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-86702008000500014 Contribuição das fontes de sedimentos em uma bacia hidrográfica agrícola sob plantio direto Rev. Bras. Ciênc. Solo Tiecher,Tales; Minella,Jean Paolo Gomes; Miguel,Pablo; Alvarez,Jimmy Walter Rasche; Pellegrini,André; Capoane,Viviane; Ciotti,Lucas Henrique; Schaefer,Gilmar Luiz; Santos,Danilo Rheinheimer dos. O conhecimento das principais fontes difusas de produção de sedimento pode aumentar a eficiência de utilização dos recursos públicos, investidos em estratégias de gestão em bacias hidrográficas, que visem mitigar a transferência de sedimentos aos cursos d'água. Objetivou-se com este trabalho avaliar as fontes de sedimentos numa bacia hidrográfica rural de cabeceira com predomínio de cultivos anuais sob plantio direto e com intensa e inadequada exploração dos recursos naturais, por meio da quantificação da contribuição relativa das estradas e das lavouras na produção global de sedimentos. A bacia hidrográfica está localizada no município de Júlio de Castilhos, Rio Grande do Sul. O período de estudo foi de maio de 2009 a abril de 2011. Para a identificação... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fingerprinting; Elementos traçadores naturais; Erosão hídrica. Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-06832014000200028 Diferenciação molecular de cultivares elites de bananeira PAB Jesus,Onildo Nunes de; Câmara,Terezinha Rangel; Ferreira,Cláudia Fortes; Silva,Sebastião de Oliveira e; Pestana,Kátia Nogueira; Soares,Taliane Leila. Este trabalho teve como objetivo caracterizar molecularmente genótipos elite, e recomendados, de bananeira, por meio de marcadores RAPD e microssatélites. Foram utilizados 47 primers de RAPD e 34 primers de microssatélites. Foi também conduzido um ensaio de contaminação, utilizando-se o primer AGMI 24-25, cuja variedade Tropical foi considerada a amostra-padrão, e as cultivares Caipira e Prata Graúda como contaminantes. Os marcadores permitiram separar as cultivares de acordo com a origem e a constituição genômica e definiram padrões moleculares para algumas cultivares avaliadas. As cultivares Garantida, Preciosa e Pacovan Ken apresentaram alta similaridade genética com ambos marcadores. O primer AGMI 24-25 demonstrou alta capacidade discriminatória de... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Musa spp.; Certificação genética; Proteção varietal; Fingerprinting; Marcadores moleculares. Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006001200008 DNA fingerprinting of Mycobacterium tuberculosis from patients with and without AIDS in Rio de Janeiro BJMBR Ivens-de-Araujo,M.E.; Fandinho,F.C.; Werneck-Barreto,A.M.; Gonçalves-Veloso,V.; Grinstejn,B.; Lourenço,M.K.; Werneck-Barroso,E.; Degrave,W.M.; Suffys,P.N.. Isolates of Mycobacterium tuberculosis derived from patients with AIDS from a single hospital in Rio de Janeiro were typed using a standardized RFLP technique detecting IS6110 polymorphism. Nineteen isolates were obtained from 15 different patients. Eleven distinct IS6110 patterns were found, with 4 banding patterns shared by 2 patients. The clustering value of 53% was much higher in comparison with clustering of M. tuberculosis strains from TB patients without clinical signs for HIV infection from randomly selected health centers. We present these results as preliminary data on M. tuberculosis strain polymorphism in Brazil and on the higher risk for recent transmission amongst patients with AIDS Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Tuberculosis; Fingerprinting; AIDS. Ano: 1998 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X1998000300006 Identificação de fontes de produção de sedimentos em uma bacia hidrográfica de encosta Rev. Bras. Ciênc. Solo Miguel,Pablo; Dalmolin,Ricardo Simão Diniz; Pedron,Fabrício de Araújo; Moura-Bueno,Jean Michel; Tiecher,Tales. O uso do solo fora de sua aptidão agrícola é o que norteia a degradação dos recursos naturais por meio das atividades antrópicas. As atividades agropecuárias estão entre as que mais perturbam o meio ambiente, expondo o solo à ação dos processos erosivos e acelerando a transferência de sedimentos aos corpos de água. Nos últimos anos, o método fingerprinting para identificação de fontes de sedimentos tem sido utilizado com sucesso no mundo, porém, trabalhos dessa natureza realizados no Brasil ainda estão em caráter incipiente. O objetivo deste trabalho foi estimar a proporção de contribuição das principais fontes de produção de sedimentos de uma bacia hidrográfica de encosta, onde predominam solos rasos e agricultura menos intensiva no sistema familiar. Essa... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fingerprinting; Elementos traçadores; Erosão hídrica; Áreas de encosta. Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-06832014000200023 Identificación de Cultivares y Líneas de Mejoramiento de Arroz de Chile Mediante Amplificación de Fragmentos Polimórficos (AFLP) Agricultura Técnica Aguirre,Carlos; Alvarado,Roberto; Hinrichsen,Patricio. Doce cultivares y líneas de arroz (Oryza sativa L.) desarrollados por el programa de fitomejoramiento del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA), Centro Regional de Investigación Quilamapu, fueron caracterizados genéticamente mediante amplificación de fragmentos polimórficos (AFLP). De 21 combinaciones ensayadas, sólo 16 fueron informativas, generando un total de 667 amplicones, 94 de ellos polimórficos (14,4%), con un rango entre 9 y 33% de polimorfismo por combinación. Esto indica que el material manejado por el programa de INIA presenta un bajo nivel de diversidad genética comparado tanto con germoplasma silvestre de la especie como con aquel usado por otros programas de fitomejoramiento de la especie. Los amplicones polimórficos detectados... Tipo: Journal article Palavras-chave: Diversidad genética; Fingerprinting; AFLP; Pedigrí; Cultivares chilenos de arroz. Ano: 2005 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072005000400002 Identification of a minimal microsatellite marker panel for the fingerprinting of peach and nectarine cultivars Electron. J. Biotechnol. Rojas,Gabriela; Méndez,Marco A; Muñoz,Carlos; Lemus,Gamalier; Hinrichsen,Patricio. The genetic characterization of 117 peach and nectarine cultivars (Prunus persica (L.) Batsch) using microsatellite (SSR) markers is presented. Analyzed genotypes include the complete list of cultivars under intellectual property (IP) protection in Chile. One hundred and two out of the 117 cultivars under study could be identified using only 7 SSRs. Other 5 cultivars were differentiated using 3 additional markers, but 5 pairs of genotypes were not differentiable. The average expected heterozygosity for the set of markers was 0.55, ranging from 0.28 in BPPCT-008 to 0.81 in CPPCT-022, with an F value of 0.37. A Neighbor-Joining dendrogram showed that, with few exceptions, peaches and nectarines clustered separately. These results are the basis for the... Tipo: Journal article Palavras-chave: Cultivar identification; Fingerprinting; Prunus persica; Simple sequence repeats; SSR. Ano: 2008 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582008000500004 Microsatellite markers for identification of a group of italian olive accessions Scientia Agricola Muzzalupo,Innocenzo; Stefanizzi,Francesca; Salimonti,Amelia; Falabella,Rosanna; Perri,Enzo. Cultivar characterization for fruit trees certification requires fast, efficient and reliable techniques. Microsatellite markers (SSR) were used in the molecular characterization of 23 genotypes of Olea europaea subsp europaea. The DNA from the olive cultivars was analyzed using nine pre-selected SSR primers (GAPU59, GAPU71A, GAPU71B, GAPU103A, UDO99-01, UDO99-12, UDO99-28 and UDO99-39) and revealed 29 alleles, which allowed each genotype to be identified. In the dendrogram, the nine primers allowed the 23 olive genotypes to be grouped into subgroups corresponding to the same cultivar denominations. SSR markers proved to be efficient and reliable for the molecular characterization of Italian olive cultivars. Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Olea europaea; Fingerprinting; Genetic identity; Molecular markers. Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162009000500014 Microsatellite markers for identification of Prunus spp. rootstocks Scientia Agricola Bianchi,Valmor João; Sansavini,Silviero; Fachinello,José Carlos. Cultivar characterization for fruit trees certification requires fast, efficient and reliable techniques. Microsatellite markers (SSR) were used in the molecular characterization of 29 Prunus spp. rootstocks. The DNA from the rootstocks was analyzed using five pre-selected SSR primers (UDP96-005, UDP96-008, UDP96-013, UDP96-18 and UDP98-414) and revealed 81 alleles, which allowed each genotype to be identified. The UDP96-005 marker generated the most information, i.e., 23 well-distributed, polymorphic alleles among all genotypes. The 21 polymorphisms produced by UDP96-013 occurred mainly as a result of high degree of variability among genotypes of the Prunophora subgenus. In the dendrogram, the five markers allowed the 29 rootstocks to be grouped into... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Peach tree; SSR; Fingerprinting. Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162004000300011 RAPDs na caracterização genético-molecular e no estudo da variabilidade genética de cultivares de ameixeira Rev. Bras. Frutic. Bianchi,Valmor João; Fachinello,José Carlos; Schuch,Márcia Wulff. Marcadores moleculares têm sido amplamente utilizados nas mais variadas espécies frutíferas para análise de "fingerprinting", para o processo de certificação de material vegetal e como ferramenta auxiliar em programas de melhoramento genético, para acessar a variabilidade genética entre genótipos. Dado a importância da cultura da ameixeira para a região Sul do Brasil, o presente trabalho teve por finalidade contribuir para a caracterização genético-molecular de 17 cultivares. As cultivares foram analisadas com 12 marcadores RAPD, que produziram 187 polimorfismos. O marcador OP A20 foi o mais polimórfico, produzindo 26 perfis diferentes. A análise de agrupamento, realizada com o método UPGMA, produziu um dendrograma que permitiu uma clara separação das... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Prunus spp.; Marcadores moleculares; Fingerprinting. Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452003000200022 SECUENCIAS DE MICROSATÉLITES ASOCIADAS A GENES DE PROTEÍNAS DE RESERVA EN VARIEDADES CHILENAS DE TRIGO HARINERO: DESCRIPCIÓN Y POSIBLE USO COMO MARCADORES DE CALIDAD PANADERA Agricultura Técnica Zerené Z.,Mireya; Granger S.,Denise; Prehn R.,Doris; Hinrichsen R.,Patricio. Se caracterizaron 39 genotipos chilenos de trigo harinero mediante el análisis de alelos de microsatélites (SSR) asociados a un gen de glutenina de bajo peso molecular (LMWG) y a un pseudo-gen de gamma -gliadina. Se detectaron ocho alelos para el locus de LMWG y nueve para el de gamma -gliadina, incluido un alelo nulo. Desde un punto de vista de la identificación genética, un 44% de las variedades estudiadas presentaron combinaciones de alelos únicas. Parte de los genotipos caracterizados por SSR fue sometido a pruebas tradicionales de calidad panadera. Estos resultados fueron correlacionados con los alelos de SSR determinados, usando una metodología que permite comparar variables cualitativas con variables cuantitativas. Se encontraron asociaciones... Tipo: Journal article Palavras-chave: ADN; Fingerprinting; Calidad panadera; Gliadina; Glutenina. Ano: 2000 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072000000100002 Universal tail sequence-SSR applied to molecular characterization of tropical maize hybrids Scientia Agricola Ribeiro,Carlos Alexandre Gomes; Pinto,Marcos de Oliveira; Maciel,Talles Eduardo Ferreira; Pastina,Maria Marta; Barros,Everaldo Gonçalves de; Guimarães,Claudia Teixeira. ABSTRACT The development of efficient and low-cost genotyping methods is essential to precise genetic characterization of cultivars. Here, we present a system based on fluorescently labeled universal tail sequence primers (UTSP) to resolve microsatellite (SSR) markers as an alternative for molecular fingerprinting of maize. A set of 20 SSRs using the UTSP presented an average polymorphic information content of 0.84, which provided a probability of random identity ranging from 10−7 to 10−14, and a minimum exclusion power of 99.99998 % in a group of 48 tropical maize single-cross hybrids traded in Brazil. The genetic diversity analysis based on multidimensional scaling explained approximately 28 % of the total variance for the first two coordinates, tending... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Zea mays; Fingerprinting; Genotyping; Cultivar protection. Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162017000200163 Variáveis mineralógicas preditoras de fontes de produção de sedimentos, em uma bacia hidrográfica do Rio Grande do Sul Rev. Bras. Ciênc. Solo Miguel,Pablo; Dalmolin,Ricardo Simão Diniz; Pedron,Fabrício de Araújo; Moura-Bueno,Jean Michel. O uso da mineralogia como ferramenta para a avaliação das propriedades dos minerais que compõem o solo é extremamente importante para o entendimento das diferentes relações químicas e físicas que ocorrem nele. Essas propriedades/variáveis, na identificação das fontes de sedimentos em suspensão, podem ajudar a elucidar os fatores e processos que regem a transferência de sedimentos e poluentes dos sistemas terrestres para os sistemas aquáticos. Os objetivos deste estudo foram caracterizar quantitativamente a mineralogia do solo das fontes e dos sedimentos em suspensão, em uma bacia hidrográfica, e identificar quais variáveis mineralógicas possuem propriedades traçadoras. Para a identificação das fontes, foi utilizado o método fingerprinting, que compara os... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fingerprinting; Elementos traçadores; Mineralogia. Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-06832014000300010 Registros recuperados: 18 Primeira ... 1 ... Última

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